《怪医文三块》共33集，分集剧情如下：
1-5集：民国时期，保定城有一个军阀阎司令。这阎司令家眷众多，却得了个怪病，夜夜梦见恶鬼缠身，还因此失手杀人。找遍了城内的大夫，大家都束手无策，无法治愈阎司令的怪病。
6-10集：阎司令向身边的副官道出于世勋的往事，他表示自己只能保文三块一时，之后于世勋若还要难为文三块，只能让他自求多福了。文三块的三块堂开在御医张宗翰的诊所对面，几日来大兵驻扎在门口，一个敢上门看病的病人都没有。
11-15集：朱局长一死，于世勋再次讨好王副厅长，王副厅长打算提拔他。绿袖的病眼瞅着好起来了，菊花劝文三块送走绿袖，文三块不愿意，两个人大吵起来。绿袖含泪感激菊花，菊花心软了，感到过意不去。
16-20集：紫玉留学归国，在六国饭店召开舞会邀请文三块参加。文三块临时有急诊没来，拜托菊花前来参加。王副厅长带海东升一道来，海东升被紫玉的风采倾倒，对她一见钟情。海东升向紫玉邀舞，菊花跟丁太太都觉得二人郎才女貌，非常般配。丁福天想让王副厅长为紫玉谋一份工作，紫玉不喜欢。
21-25集：由于王次长从中作梗，文三块被抄家查办。文三块将成元等人交付给张宗翰，自己带上行李独自远行。听说文三块的事情，菊花心中担心，表面却还做出一副痛快的样子，和车母产生冲突，回到家后，车菊花痛哭发泄心中委屈，更加深了对丁紫玉的怨恨。
26-30集：当晚，文三块交代后事，就算死也不肯向日本人妥协，全家为文三块的安危担忧不已。早餐后，丁紫玉将迷药放在茶壶中骗文三块喝下，文三块醒来发现自己被绑了起来，恼怒不已。
31-33集：丁紫玉回到家，她已经知道了丁福天和日本人的关系，她要求父亲跟日本人断绝来往，丁福天坚定地认为自己的道路是正确的，不肯改变。
剧集评价
电视剧《怪医文三块》讲述了草医文三块以自己神奇医术成为一代名医的传奇经历。该剧不仅剧情动人，反派人物更是展现民族大爱，如杨立新此次诠释的角色有着很深的民族气节，让人又爱又恨。
尽管他一直是剧中的反派角色，但当民族危机来临，于世勋却能以民族大义为重，以个人恩怨为轻，几次暗中帮助文三块，显示出了这个人物的民族气节。
除了民族大爱之外，于世勋在与菊花、文三块的这段三角之恋中也显现出他的真性情，不管是因为真情，还是责任，被牵进感情三角阵的三人，他们向人们展示出了真性情。
